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Gestion durable des ressources, bioéconomie, transition écologique
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Santé, biologie
Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (PVBMT)
L'UMR PVBMT élabore des méthodes innovantes de lutte contre les ravageurs, les maladies et les adventices des agrosystèmes, mais aussi de nouveaux modes de conservation des milieux forestiers indigènes. Les recherches et les formations associées de l'unité concernent la protection des cultures tropicales et la préservation de la biodiversité des écosystèmes terrestres. Ses champs d'investigation sont l'épidémiologie végétale (épidémiosurveillance et adaptation des populations de micro-organismes phytopathogènes), la dynamique des populations d'insectes et les interactions trophiques, la génétique et la caractérisation de la résistance des plantes aux bioagresseurs, l'endémisme et les invasions des écosystèmes terrestres naturels en milieu insulaire.
- Mme FOCK-BASTIDE Isabelle
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Mme Tetiana KWAN TAT
Chargée d'affaires Marketing Entreprises - Mme Hélène Delatte
permanent à La Réunion
Post-doctorants
Offre de services
Conservation et valorisation des ressources génétiques végétales (CRB Vatel)
Analyses moléculaires des pathogènes et ravageurs (virus, bactéries, phytoplasmes)
Diagnostic de maladies des cultures
Prestation-conseil en entomologie
Evaluation de résistance ou de sensibilité variétale
Conseil scientifique pour projets R&D, programmes de sélection ou valorisation d’espèces locales
Expertises
Génomique et épidémiologie des agents pathogènes émergents
Diversité et utilisation durable des ressources génétiques végétales en milieu tropical
Dynamiques écologiques en milieu insulaire
Offres de technologies
COV et Plants patents :
- Vanille Handa (COV + PP)
- Oignon Ernestine (COV)
Inscription au catalogue officiel
- 4 variétés d'aubergine (Bringelle rond, bringelle saucisse, Kalenda/Kalouda, bringelle Costo)
- 2 variétés d'ail (Ti Rouge et Vacoa)
- 1 variété de piment (Aiguille)
- 1 variété d'oignon (Ernestine)
Savoir-faire secret valorisé :
- Méthode de diagnostic de Xanthomonas axonopodis pv. Allii
- Méthode de diagnostic de Xanthomonas axonopodis pv dieffenbachiae
Offres de valorisation
Méthodes mises au point en cours de valorisation et de transfert
Test de détection de Xanthomonas axonopodis pv. allii (bactérie du dépérissement de l'oignon) dans les semences
Test de détection des principaux organismes de quarantaine de la pomme de terre
Test de détection des principaux organismes de quarantaine de la tomate
Thématiques S5
- Écosystèmes terrestres
- Économie verte
- Santé
Thématiques stratégiques
Santé, biologie
- Epidémiologie
- Mécanismes mOléculaires et Cellulaires des Agents biologiques infectieux
- Bio-informatique
Gestion durable des ressources, bioéconomie, transition écologique
- Biodiversité et préservation/restauration des milieux naturels et artificialisés
- Agronomie, aliments, nutrition
- Forêt bois
- Protection des plantes
Technologies clés
- 4 Modélisation, simulation et ingénierie numérique
- 18 Métaomique
- 19 Analyse comportementale
- 27 Solutions innovantes de protection et de stimulation des végétaux
Equipements disponibles
* Plate-forme de protection des plantes (3P) à Saint-Pierre :
- Microbiologie : Agitateurs, thermocycleur, broyeurs, centrifugeuses, électroporateurs, ensemenceur Spiral, étuves, incubateurs avec plateau agité, hottes à flux laminaire, poste de sécurité microbiologique type II, ...
- Biologie moléculaire : Salle ADN ancien, salle ARN, salle PCR-mix (ADN/ARN-free), centrifugeuses, électrophorèse, thermocycleurs, QPCR et digital PCR
- Culture in vitro : 3 Chambres de culture, Étuve réfrigérée thermorégulée, agitateurs magnétiques, loupe binoculaire...
- Analyse de semences : chambre climatique et chambres froides
- Chambres climatiques NS2, chambres d'élevage
- Microscopie : Agitateur magnétique chauffant, Loupes binoculaires, Macroscope Nikon AZ100 motorisé axe Z, Microscope Nikon NiU motorisé axe Z, Microscope inversé Eclipse TS 2R, Stéréomicroscope Nikon SMZ25, ...
- Laboratoire NS3
- Mycologie : bains ultrasons, déshumidificateur, études, fireboys, ...
- Entomologie générale : armoires climatiques...
- Entomologie chimique et électrophysiologie : olfactomètres, tunnel de vol, EAG, GC-MS, Sorbonnes, ...
- Production plants sains : rotoplants, serre insect-proof...
- Ressources génétiques
- Stérilisateurs à insectes XRAD320
* Stations expérimentales: Ligne-Paradis, Bassin Plat, Bassin Martin, La Mare - 20 hectares de surfaces agricoles, 1500 m2 de serres polycarbonate, 6000 m2 de serres tunnel insect-proof ou ombrières.
Mots clés
- Phytopathologie
- Bioagresseurs
- Pathogènes émergents
- Virus
- Bactéries
- Phytoplasmes
- Diagnostic moléculaire
- Séquençage haut débit
- Génomique
- Épidémiologie moléculaire
- Phylogénie
- Biologie évolutive
- Biologie des populations
- Bio-informatique
- Résistance variétale
- Sélection de plantes
- Ressources génétiques végétales
- Conservation in situ
- Biodiversité
- Légumes lontan
- Plantes patrimoniales
- Plantes indigènes
- Vanille
- Igname
- Patate douce
- Manioc
- Brèdes
- Légumineuses
- Gestion agroécologique
- Agroécosystèmes tropicaux
- Ravageurs
- Insectes et acariens
- Auxiliaires de culture
- Lutte biologique
- Biocontrôle
- Espèces invasives
- Écosystèmes insulaires
- Surveillance épidémiologique
- Outils de détection
- Sécurité sanitaire
- Adaptation climatique
- Résilience agricole
- Développement durable
- Océan Indien
Tutelle
Université de La Réunion, CIRAD
Ecosystème
Partenariats socio-économiques
1. Projet RAFA (acteur socio-économique : VILMORIN MIKADO): identifier de nouveaux facteurs génétiques majeurs de résistance, efficaces contre les souches prévalentes en Chine et à La Réunion, dans le but de construire une résistance composite au flétrissement bactérien via une stratégie de pyramidage des gènes/QTLs. Les prochaines étapes consisteront à développer des marqueurs moléculaires génétiquement liés aux gènes/QTLs à pyramider, et d'estimer la faisabilité de leur utilisation dans les programmes de breeding.
2. Projet TOAROVA (acteur socio-économique : CHANEL): utilisation de la diversité génétique pour améliorer la résilience des plantations de vanille face au changement climatique.
3. Projet Horizon Europe REACT (acteurs socio-économiques: CRI South Africa, inSilico-IPM Poland, IOKOPLUS Austria) : développer des stratégies de réponse respectueuses de l'environnement à long terme et de nouveaux outils durables pour protéger les capacités de production et d'exportation de fruits et légumes contre deux insectes ravageurs envahissants prioritaires pour l'UE, Bactrocera dorsalis et Bactrocera zonata.
4. Projet INDICANTS (acteur socio-économique: QUALIPLANTE) : développement d'outils moléculaires innovants pour le diagnostic rapide sur le terrain de quatre maladies vasculaires du bananier qui sévissent dans de nombreuses zones de production. Deux types de méthodes POC (Point of Care) sont développées dans le cadre de ce projet : 1) des kits de détection LAMP (Loop-mediated isothermal amplification) pour le diagnostic des quatre agents pathogènes, 2) technologie émergente (CRISPR/Cas12a) pour le diagnostic de FocTR4.
5. Projet ENDEMIEL (acteur socio-économique: commune du Tampon) : création d'un corridor écologique d'espèces mellifères le long d'un itinéraire de 36 Km de routes, appelé « route mellifère » allant de 400 à 1600 m avec de 52 000 individus, issus d’une quarantaine d’espèces , 4 « jardins endémiques » représentant les différents habitats naturels qui existaient auparavant le long de ce gradient altitudinal avec environ 9000 plants.
6. Projet VANISEQ (acteurs socio-économiques : Eurovanille et MANE) : développer des ressources et données génomiques sur la vanille (Vanilla planifolia) afin de mieux comprendre sa structure génétique et d’enrichir les connaissances nécessaires à l’amélioration variétale et à la valorisation de cette espèce à haute valeur économique.
7. Projet RemiNat (acteur socio-economique : Parc National de la Réunion, ONF, Conservatoire botanique national Mascarin, Edden) : Restaurer les fonctionnalités des milieux naturels, accompagner et renforcer les opérateurs en restauration écologique avec des expérimentations et des outils innovants, fédérer les partenaires autour d'une stratégie spatialisée et opérationnelle pour restaurer la fonctionnalité des milieux naturels et de ses interfaces, structurer la collecte et la diffusion de données.
Partenariats scientifiques
1. Projet AttracTIS-Ecophyto OFB (2023-2025) : développement d'outils de biocontrôle contre Bactrocera dorsalis à La Réunion: la Tehnique de l'Insecte Stérile (TIS) combinée à un attractif de femelles.
https://umr-pvbmt.cirad.fr/recherche/principaux-projets/attractis
2. ANR BAOBAB (Jeune chercheur) : (2024-2027) : Bactériocines de bactéries phytopathogènes et leur potentiel comme agents de biocontrôle.
3. ANR CALIBEVOL (Jeune chercheur) : (2025-2028) Génomique de la phylogénie, de l'évolution et du diagnostic des bactéries responsables de la maladie du huanglongbing des agrumes.
4. ANR HOLOBEEONT : (2025-2028) Le projet apportera un nouvel éclairage sur les réponses de l’holobionte de l’abeille mellifère aux perturbations biotiques et abiotiques, en produisant des données originales, indispensables à l’amélioration de la conservation et de la gestion des abeilles dans un environnement changeant. Partenaires : UMR PVBMT, Université Clermont-Auvergne, INRAe, ANSES, GDS.
Liens partenariats scientifiques
Exemples de travaux
Développement de diagnostic moléculaire
- Développement de tests LAMP pour le diagnostic sur le terrain de quatre maladies vasculaires de la banane (fusariose, Moko, banana Blood disease et flétrissement bactérien)
- Développement d'un test de détection rapide de SARS-COV 2
- Diagnostic de Xanthomonas axonopodis pv. dieffenbachiae, bactérie du dépérissement de l'anthurium
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Assainissement et création de variétés
- Aulx assainis : Ti Rouge, Vacoa
- oignons : Ernestine
- Maïs : CIRAD 412 (population), CIRAD 414 et 415 (hybrides)
- Aubergines : Bringelle rond et bringelle saucisse
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Lutte biologique, agents de biocontrôle, Technique de l'insecte stérile
- Développement d’attractifs et auto-dissémination de champignons entomopathogènes pour lutter contre la mouche du melon Bactrocera cucurbitae
- Gestion agroécologique des populations de ravageurs des cultures fruitières et maraîchères
- Production durable de mangues sans insecticides
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Projets de recherche
Gestion et dynamique des Plantes Exotiques Envahissantes ; Afafi sud :Appuyer l’agroécologie dans le Sud et le Sud-Est de Madagascar; Mise en valeur et MUtualisation des connaissances de la biodiversité marine et terrestre lndian Océanique, Patrimoine à Sauvegarder; " Towards Agroecology Transition in the Mekong Region" : ACP-ACTAE Project
Lien publications
Lien projets de recherche
7 chemin de l'IRAT
Pôle de protection des Plantes
97410 SAINT-PIERRE